Uno de los efectos secundarios mas difíciles de solucionar en el tratamiento con brackets de ortodoncia es la deglución atípica. Consiste en la interposición lingual al tragar, con lo cual cuando los dientes están móviles por el efecto de los alambres, los dientes tienden a adelantarse. Este efecto es muy difícil de solucionar una vez producido.
Con los alineadores esto no sucede, ya que el efecto secundario de empuje lingual de los dientes se controla por la ferulización de todo el alineador. El alineador actúa como sujeción del efecto de adelantamiento de la lengua. con lo que evita ese efecto nocivo. En bastantes casos el paciente aprende a reposicionar la lengua a lfinal del tratamiento.